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分析试验室

浪潮AI助力生物岛实验室科研创新

北京,2021年6月25日——生物医药产业是世界新一轮科技和产业革命的重点领域,算力成为破解生命奥秘的“钥匙”。作为生物医药产业的南方“硅谷”,生物岛实验室选择浪潮AI服务器NF5488A5和高密服务器i48搭建生物医药大数据科创平台,全基因组测序效率提升20倍,大幅加速科学研究的进展。 .

生物岛实验室是广东省首批以培养建设国家实验室、建设国家实验室“后备队”为目标的省级实验室”,以干细胞为目标,以再生医学理论和技术的前沿研究,致力于建设重大科技基础设施和平台,打造前沿研究基地、临床应用基地、成果转化和产业化基地和高级再生医学与健康人才基地,推动生物医学与健康产业高质量发展。

为确保再生医学前沿基础研究、临床创新研究、生物信息学、生物安全研究、高端生物医疗器械耗材研发等重点科研项目顺利开展,生物岛实验室推进数据科技创新平台建设。一方面,平台将为数据资源获取、数据交易、数据共享、科研、成果发布、成果转化落地、生物信息学标准制定等业务系统提供全周期支持服务,帮助临床医生提高科研效率。促进科研创新;另一方面,支持和保障生物医药大数据供需双方和技术支持者共同参与的产业联盟雏形的建立。

数据量大、计算能力要求高是生物医学研究的突出特点。人类基因组包含30亿个碱基对,一次全基因组测试将产生超过100G的海量数据。即使是对人体局部进行测序,大样本的批量处理也会带来极高的计算需求。以结直肠癌测序为例,需要在2000对4000例(每个患者一个正常组织和一个癌组织)的测序数据上完成一次全基因组测序(WGS)。以医疗机构现有设施为基础,需要较长时间。几年来。

生物医学研究除了分析效率低,还给数据存储和传输带来挑战:数据增长快、存储成本高、维护成本高;传统的硬盘交付方式周期长、效率低,多中心数据共享访问困难,无法充分发挥医疗数据的价值。

加速20倍算力为生物医学研究增添“翅膀”

生物岛实验室主要涉及基因测序、医学图像的 3D 重建、医学图像分析和其他 HPC 和 AI 应用。详细了解需求后,浪潮为生物岛实验室提供“HPC+AI”数据中心解决方案,集成浪潮AI服务器NF5488A5、高密服务器i48、基于BeeGFS的并行存储系统,整体计算能力超过petaflops,可用存储空间大于3PB,充分满足生物医学研究对计算分析和数据存储的需求,助力生物医学大数据科技创新平台建设。

其中,浪潮AI服务器NF5488A5承担医学影像分析、AI辅助诊断等相关应用研究工作。 NF5488A5性能强大,一台相当于1000台普通服务器,有利于支持海量生物实验室。医学影像数据的计算大大提高了AI模型的训练效率。浪潮i48可以在4U空间内部署8种不同类型的双通道计算节点,具有高扩展性和高可用性。生物岛实验室基于浪潮i48,开展了基因测序的HPC应用工作,将人类和类哺乳动物全基因组组装时间缩短至2天以内。除了硬件平台,浪潮还为生物岛实验室配置了HPC集群管理平台ClusterEngine,打通硬件运维、业务管理和应用性能分析,大幅提升HPC集群的资源利用率和计算效率.

相比传统解决方案,浪潮解决方案不仅可以提供强大的算力支持、大容量存储和更低的TCO,还可以实现PB级数据共享,充分挖掘医疗数据的价值,显着提高数据处理的效率。以大肠癌测序为例,该平台可以在两个月内完成4000个样本的全基因组测序(WGS),效率比之前的“年”计算周期提高20倍。

生物岛实验室破解生命密码

推出新型冠状病毒核酸现场快速检测产品“分子检测卡” , 将检测时间控制在半小时以内 建立基于癌症和癌旁组织的类器官生物库,推动抗癌药物的研发;推进免疫细胞再生转化研究,利用干细胞的再生潜能治疗多种“重症”等,是生物医药产业的新成果,也是价值的重要体现。生物岛实验室。

今天,生物岛实验室生物医学大数据科技创新平台已经全面投入使用。基于该平台,生物岛实验室正在构建临床组学智能分析系统,整合基因组学、代谢组学、蛋白质组学、表观遗传学等多维组学测序数据,规范组学数据的存储和管理,为临床组学提供广泛的数据基础支持。临床组学研究。同时,通过基因组学数据与临床大数据的融合,拓展科研维度,提升科研水平,巩固学术地位,促进基础医学成果向临床转化。

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